CHARAFE-JAUFFRET Emmanuelle

Membre du Conseil d'Administration

CHARAFE Emmanuelle épouse JAUFFRET

Née le 22 août 1970 à Marseille

Département de Biopathologie, Institut Paoli-Calmettes, 232 Bd de Ste Marguerite, 13009 Marseille

Statut actuel : MCU-PH

 

DIPLOMES ET TITRES UNIVERSITAIRES

  •   1988 : Baccalauréat, série C, Marseille
  •   1989 : PCEM 1 (Faculté Timone, Marseille)
  •   1991 : Certificat de bactériologie générale (C.1) et de virologie générale (C.2)
  •   1992 : Certificat de méthodologie en anatomo-pathologie (C.1) et Maîtrise de sciences biologiques et médicales (Faculté de médecine de Marseille)
  •   1994 : Concours d’Internat en Médecine, interrégion Sud, Marseille, filière « Spécialités médicales ».
  •   1997 : Certificat de biochimie et pathologie moléculaire (C.2)
  •   1998 : DEA de Biologie cellulaire, structurale et microbiologie (mention AB)
  •   1999 : Diplôme d’Etudes Spéciales en Anatomie et Cytologie Pathologiques
  •   1999 :Thèse d’état pour le doctorat en Médecine Spécialisée
  •   2003 : Obtention du grade de MCU-PH, faculté de médecine de Marseille
  •   2004: Thèse de 3ème cycle Biologie des Eucaryotes (mention très honorable)
  •   2007 : Obtention du niveau 1 d’Expérimentation Animale (INSERM)
  •   2008 : Expérimentation animale spécialisation chirurgie (2008).
  •   2009 : Habilitation à diriger des Recherches (HDR), Université de la Méditerranée, Faculté de Médecine.
  •   2011 : Contrat d’interface INSERM pour hospitalier

 

titres hospitaliers et hospitalo-universitaires

  •   Internes DES de Novembre 1994 à Avril 1999 : CHU marseille
  •   Assistante Hospitalière Universitaire (AHU), Institut Paoli-Calmettes, Marseille, 1er mai 99.
  •   Maître de Conférences-Praticien Hospitalier (MCU-PH), 1er septembre 2003
  •   Professeur des Universités-Praticien Hospitalier (PU-PH), octobre 2011

 

 

mobilité (Novembre 2005 à fin octobre 2006)

  •   Novembre 2005-Juin 2006 : mobilité type recherche dans le laboratoire du Dr A Lebivic, IBDML-UMR 6216, campus de Luminy, directrice du centre Dr G Rougon.
  •   Juillet 2006-Fin Octobre 2006 : mobilité type recherche dans le laboratoire du Dr Max Wicha (cellules souches mammaires), université du Michigan, Ann Arbor, MI, USA, directeur du centre Dr M Wicha.

 

expertises et valorisation

Commissions et vie associative :

  •   Membre élu du Bureau de l’Internat et participation au Comité Scientifique de la Faculté pour les Internes : de Décembre 1997 à Février 1999.
  •   Membre élu du Bureau des MCU-PH depuis 2007
  •   Présidente du bureau des MCU-PH depuis juillet 2009
  •   Membre du Comité scientifique de la faculté de Medecine (2006-2009)
  •   Membre du Comité scientifique de l’Université de la Méditerranée (membre élu 2008-2009)
  •   Membre du Conseil d’administration de l’Université de la Méditerranée 2010-2011
  •   Membre du Conseil d’administration de la Faculté de Médecine de Marseille depuis 2009
  •   Coordonateur d’axe Canceropole PACA 2011-2014

Expertise :

  •   participation à un groupe de travail pour la Haute Autorité de Santé/INCa en vue de l’élaboration d’un guide ALD cancer du sein, 2008
  •   participation à un groupe de travail INSERM/afsset pour une Expertise Collective cancer et environnement, en 2008-2009
  •   expert PHRC national 2008-2009 (3 dossiers évalués)
  •   expert concernant les appels d’offres du  GIS IBiSA (Infrastructures en Biologie Santé et Agronomie) et le CCRB (Comité Consultatif sur les Ressources Biologiques) 2009
  •   expert 2010 pour projets européens IMI (Inovative Medecine Initiative) affiliés FP7 (www.imi.europa.eu)
  •   expert pathologiste et membre du conseil scientifique du protocole BEVERLY2 (laboratoire Roche) :
  •   Expert pathologiste du protocole BEVERLY 1(Pacs09) (FNCLCC) 
  •   Expert comité INCa Translationnel 2012 et 2013 (évaluation des dossiers et discussion en comité, langue anglaise)
  •   Expert groupe de travail INCa pour PAIR  « sein Précoces » (coordonateur axe 1, biologie des formes précoces) 2014
  •   Expert relecteur pour de nombreuses revues (Breast Cancer Research, Cancer Research, Clin Exp Metastasis, PLOS one…)
  •   Expert 2013 pour évaluation de dossier Inserm Transfert
  •   Expert 2013 pour évaluation de dossier GIS IBiSA CRB program.
  •   Expert 2013 et 2014 pour le CC IRGE Ligue contre le cancer

 

 

 

Sociétés savantes:

  •   Membre de l’International Society for Stem Cell Research (ISSCR) depuis 2009.
  •   Membre du Groupe de Recherche Translationnelle de la Fédération des Centres de Lutte contre le Cancer (FNCLCC) 2009.
  •   Membre du groupe européen EWBCSG depuis 2012

 

  •   Membre du Groupe d'Etude des Facteurs Pronostiques par Immunohistochimie dans le Cancer du Sein (GEFPICS)
  •   Membre de l’Editorial board d’International Journal Of Breast Cancer
  •   Membre de la Société francaise de Pathologie
  •   Membre de l’European Society of Pathology

 

Organisation de conférences :

  •   Enseignement post-universitaire de pathologie mammaire, 2007-2009
  •   Colloque franco-américain “Stem cells and cancer”, sur le site du Centre de recherche en cancérologie de Marseille,
  •   Symposium du Groupe de Pathologie Cellulaire et Moléculaire (GPCM) 2008, sur cancer et cellules souches, maison de la,Chimie, 19 Novembre 2008, Paris, France
  •   Annual Breast cancer Symposium, marseille Pharo, 16 octobre 2009
  •   Symposium de la Société Française de Pathologie (Carrefour Pathologie 2012), novembre 2012, « pathologie mammaire, nouvelles entités moléculaires » (organisation du symposium et communication)
  •   Symposium Société Française de Pathologie/INSERM 2014 (Carrefour Pathologie 2014), 21 novembre 2014 sur   « Xenogreffe, avatars de tumeurs mammaires »

 

FINANCEMENTS OBTENUS

Investigateur principal :

  • Bourse de la Société française de Pathologie 1999, projet de « Recherche de pertes d’hétérozygotie sur le bras court du chromosome 8 dans les cancers du sein étudiés par microdissection Laser » (10 KF)
  • Programme Hospitalier de Recherche Clinique (PHRC) 2004, « Caractérisation moléculaire de la Maladie de Hodgkin réfractaire » (350 K euros obtenus)
  • Programme Hospitalier de Recherche Clinique 2006, « Caractérisation moléculaire des formes particulières ou agressives de cancer du sein » (420 Keuros obtenus)
  • Bourse INCA-Lilly 2006 « Caractérisation moléculaire des formes particulières de cancer du sein » (80 Keuros obtenus)
  • Programme Hospitalier de Recherche Clinique 2007, « Etude de l’effet de la chimiothérapie sur les cellules souches carcinomateuses dans le cancer du sein non métastatique traité par chimiothérapie néoadjuvante ».  (180 Keuros obtenus)
  • Projet INCa Translationnel 2011 sur les « role des cellules souches cancéreuses dans la maladie métastatique »(385 Keuros obtenus)

 

 

Co-Investigateur : Programme Hospitalier de Recherche Clinique 2008, «AVASTEM, étude de phase O « preuve de concept » évaluant  l’effet anti-cellule souche cancéreuse du Bevacizuamb en pré-opératoire en combinaison avec la chimiothérapie dans le cancer du sein  ».

 

brevets-valorisation

  • Brevet concernant l’application clinique d’un marqueur de cellules souches tumorales mammaires ALDH1 (brevet déposé sous le numéro UM-31026) avec l’Université du Michigan
  • Brevet déposé pour le traitement des cellules souches tumorales mammaires inhibant la voie de CXCR1 (brevet déposé sous le numéro UM-30695) avec l’Université du Michigan.

 

Publications-communications orales

  • 97 publications référencées et indexées, 21 en premier auteur (dont 8 articles originaux, 7 revues), 4 en dernier auteur., H index à 36
  • Elaboration de 2 articles didactiques (1 guide pour la Haute Autorité de Santé en collaboration avec l’Institut National du Cancer, 1 expertise collective Cancer et Envionnement sous l’égide de l’afsset et de l’Inserm)
  • 8 communications orales pour des congrès à comité de sélection et 17 conférences sur invitations

 

 

 

Principales publications :

 

 

 

 

1-    Pierga JY, Petit T, Lévy C, Ferrero JM, Campone M, Gligorov J, Lerebours F, Roché H, Bachelot T, Charafe-Jauffret E, Bonneterre J, Hernandez J, Bidard FC, Viens P. Pathological Response and Circulating Tumor Cell Count Identifies Treated HER2+ Inflammatory Breast Cancer Patients with Excellent Prognosis: BEVERLY-2 Survival Data. Clin Cancer Res. 2015 ;21(6):1298-304.

 

2-    Gilabert M, Launay S, Ginestier C, Bertucci F, Audebert S, Pophillat M, Toiron Y, Baudelet E, Finetti P, Noguchi T, Sobol H, Birnbaum D, Borg JP, Charafe-Jauffret E, Gonçalves A.Poly(ADP-ribose) polymerase 1 (PARP1) overexpression in human breast cancer stem cells and resistance to olaparib.PLoS One. 2014 21;9(8):e104302.

 

3-    El Helou R, Wicinski J, Guille A, Adélaïde J, Finetti P, Bertucci F, Chaffanet M, Birnbaum D, Charafe-Jauffret E, Ginestier C. A distinct DNA methylation signature defines breast cancer stem cells and predicts cancer outcome. Stem Cells. 2014 32(11):3031-6.

 

4-    Liu S, Cong Y, Wang D, Sun Y, Deng L, Liu Y, Martin-Trevino R, Shang L, McDermott SP, Landis MD, Hong S, Adams A, D'Angelo R, Ginestier C, Charafe-Jauffret E, Clouthier SG, Birnbaum D, Wong ST, Zhan M, Chang JC, Wicha MS. Breast cancer stem cells transition between epithelial and mesenchymal states reflective of their normal counterparts.Stem Cell Reports. 2013 27;2(1):78-91.

 

5-    Charafe-Jauffret E, Ginestier C, Bertucci F, Cabaud O, Wicinski J, Finetti P, Josselin E, Adelaide J, Nguyen TT, Monville F, Jacquemier J, Thomassin-Piana J, Pinna G, Jalaguier A, Lambaudie E, Houvenaeghel G, Xerri L, Harel-Bellan A, Chaffanet M, Viens P, Birnbaum D. ALDH1-positive cancer stem cells predict engraftment of primary breast tumors and are governed by a common stem cell program. Cancer Res. 2013 15;73(24):7290-300.

 

6-    Ginestier C, Charafe-Jauffret E, Birnbaum D Targeting breast cancer stem cells: fishing season open!. Breast Cancer Res. 2010 ;12(5):312

 

7-    CHARAFE-JAUFFRET E,  GINESTIER C, IOVINO F, TARPIN C, DIEBEL M, ESTERNI B, HOUVENAEGHEL G, EXTRA JM, BERTUCCI F, JACQUEMIER J, XERRI L, DONTU G, STASSI G, XIAO Y, BARSKY S, BIRNBAUM D,VIENS P AND WICHA MS. Aldehyde Dehydrogenase 1–Positive Cancer Stem Cells mediate metastasis and poor clinical outcome inInflammatory Breast Cancer.

Clin Cancer Res. 2010 ;16(1):45-55

 

8-    GINESTIER C, Liu S, Diebel ME, Korkaya H, Luo M, Brown M, Wicinski J, Cabaud O, Charafe-Jauffret E, Birnbaum D, Guan JL, Dontu G, Wicha MS. CXCR1 blockade selectively targets human breast cancer stem cells in vitro and in xenografts.

J Clin Invest. 2010;120(2):485-97

 

9-    Charafe-Jauffret E, Ginestier C, Birnbaum D. Cancer stem cells: just sign here!

Cell Cycle. 2010; 9(2).(News and Views)

 

 

10-JACQUEMIER J, CHARAFE-JAUFFRET E, MONVILLE F, ESTERNI B, EXTRA JM, HOUVENAEGHEL G, XERRI L, BERTUCCI F, BIRNBAUM D. Association of GATA3, P53, Ki67 status and vascular peritumoral invasion are strongly prognostic in luminal breast cancer

Breast Cancer Res. 2009;11(2):R23. Epub 2009 Apr 30

 

11-CHARAFE-JAUFFRET E, GINESTIER C, IOVINO F, WICINSKI J, CERVERA N, FINETTI P, HUR MH, DIEBEL M, MONVILLE F, DUTCHER J, BROWN M, VIENS P, XERRI L, BERTUCCI F, STASSI G, DONTU G, BIRNBAUM D, WICHA M. Breast cancer cell lines contain functional cancer stem cells with metastatic capacity and a distinct molecular signature.

Cancer Research 2009; 69(4):1302-13

 

12-Charafe-Jauffret E, Ginestier C, Birnbaum D

Breast cancer stem cells: tools and models to rely on.

                   BMC Cancer. 2009; 9:202

 

13-Ginestier C, Wicinski J, Cervera N, Monville F, Finetti P, Bertucci F, Wicha MS, Birnbaum D, Charafe-Jauffret E.

Retinoid signaling regulates breast cancer stem cell differentiation.

Cell Cycle. 2009;8(20): 3297-302

 

14-Korkaya H, Paulson A, Charafe-Jauffret E, Ginestier C, Brown M, Dutcher J, Clouthier SG, Wicha MS.

Regulation of mammary stem/progenitor cells by PTEN/Akt/beta-catenin signaling.

PLoS Biol. 2009;7(6):e1000121. Epub 2009 Jun 2

 

15-BREMER TM, JACQUEMIER J, CHARAFE-JAUFFRET E, VIENS P, BIRNBAUM D, LINKE SP.Prognostic marker profile to assess risk in stage I-III hormone receptor-positive breast cancer patients.

Int J Cancer. 2009; 124(4): 896-904

 

16-Gonçalves A, Deblock M, Esterni B, Tarpin C, Bertucci F, Gilabert M, Charafe-Jauffret E, Jacquemier J, Houvenaeghel G, Extra JM, Viens P. Docetaxel first-line therapy in HER2-negative advanced breast cancer: a cohort study in patients with prospectively determined HER2 status. Anticancer Drugs. 2009; 20(10): 946-52

 

17-FINETTI P, CERVERA N, CHARAFE-JAUFFRET E, CHABANNON C, CHARPIN C, CHAFFANET M, JACQUEMIER J, VIENS P, BIRNBAUM D, BERTUCCI F.Sixteen-kinase gene expression identifies luminal breast cancers with poor prognosis. Cancer Res. 2008; 68(3):767-76

 

18-LIU S, GINESTIER C, CHARAFE-JAUFFRET E, FOCO H, KLEER CG, MERAJVER SD, DONTU G, WICHA MS. BRCA1 regulates human mammary stem/progenitor cell fate. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008;105(5):1680-5

 

19-GONÇALVES A, CHARAFE-JAUFFRET E, BERTUCCI F, AUDEBERT S, TOIRON Y, ESTERNI B, MONVILLE F, TARPIN C, JACQUEMIER J, HOUVENAEGHEL G, CHABANNON C, EXTRA JM, VIENS P, BORG JP, BIRNBAUM D. Protein profiling of human breast tumor cells identifies novel biomarkers associated with molecular subtypes. Mol Cell Proteomics. 2008; 7(8): 1420-33

 

20-CHARAFE-JAUFFRET E, TARPIN C, VIENS P, BERTUCCI F. Defining the molecular biology of inflammatory breast cancer. Semin Oncol. 2008 Feb;35(1):41-50

 

21-CHARAFE-JAUFFRET E, MONVILLE F, GINESTIER C, DONTU G, BIRNBAUM D, WICHA MS. Cancer stem cells in breast: current opinion and future challenges.Pathobiology. 2008;75(2):75-84  

 

22-CHARAFE-JAUFFRET E, JACQUEMIER J, LABID S I, BEN HAMIDA A, BEN ROMDHANE K, BEN ABDALLAH M, GINESTIER C, ESTERNI B, BIRNBAUM D, BEN AYED F, XERRI L, VIENS P, MEZLINI A. Inflammatory breast cancers in Tunisia and France show similar immunophenotypes Breast. 2007; 16(4):352-358  

 

23-CHARAFE-JAUFFRET E, MONVILLE F, BERTUCCI F, ESTERNI B, GINESTIER C, FINETTI P, CERVERA N, GENEIX J, HASSANEIN M, RABAYROL L, SOBOL H, TARANGER-CHARPIN C, XERRI L, VIENS P, BIRNBAUM D, JACQUEMIER J.Moesin expression is a marker of basal breast carcinomas. Int J Cancer. 2007 ;121(8):1779-85

 

24-GINESTIER C, HUR MH, CHARAFE-JAUFFRET E, MONVILLE F, DUTCHER J, BROWN M, JACQUEMIER J, VIENS P, KLEER C, LIU S, SCHOTT A, HAYES D, BIRNBAUM D, WICHA MS, DONTU G.

ALDH1 is a marker of normal and malignant human mammary stem cells and a predictor of poor clinical outcome. Cell Stem Cell 2007; 1: 555-567

 

25-CHARAFE-JAUFFRET E, GINESTIER C, MONVILLE F, FINETTI P, ADELAIDE J, CERVERA N, FEKAIRI S, XERRI L, JACQUEMIER J, BIRNBAUM D, BERTUCCI F. Gene expression profiling of breast cell lines identifies potential new basal markers. Oncogene. 2006 ;25(15):2273-84

 

 

 

 

enseignements

Activité d’enseignement sous forme de cours, travaux pratiques et enseignements dirigés évalués à environ 120h par an. Enseignement transversal de l’anatomie pathologique focalisé ou pas sur la cancérologie mammaire (étudiants master M1 et M2, D1, D3, odontologie, interne DES, chirurgiens, oncologues)

 

aCTIVITE HOSPITALIERE

Activité hospitalière dans le service de Biopathologie de l’INSTITUT PAOLI CALMETTES, service Pr Xerri, en charge de la pathologie mammaire et gynécologique.

 

aCTIVITE de recherche

Activité de recherche dans le laboratoire d’Oncoloie Moléculaire dirigé par le Dr D Birnbaum, CRCM/INSTITUT PAOLI CALMETTES/Université de la Méditerranée.

J’anime au sein de ce laboratoire un groupe qui d’intéresse à la caractérisation des cellules souches cancéreuses dans la glande mammaire. Il est composé d’un CR1 (Dr C Ginestier), d’un technicien (1 ETP), d’un ingénieur animalier (1/2 ETP) et actuellement de 2 étudiants M2, d’une étudiante M1. Nous disposons pour isoler et caractériser ces CSC de techniques de culture cellulaire en suspension, d’une technique de cytométrie de flux basée sur l’activité d’une enzyme du métabolisme de l’acide rétinoique (technique ALDEFLUOR), de la détéction in situ sur coupe de ces cellules à l’aide d’anticorps spécifiques, et d’une banque de xénogreffe de tumeur primaire mammaire humaine dans un environnement « humanisé ». nous nous intéressons actuellement à la hiérachie cellulaire de la glande mammaire normale et au lien entre cellule d’origine du cancer (CSC) et sous type moléculaire.